どうもYouTubeのプレイヤーがHTML5のみになり、従来のプレーヤーが使用できなくなったようです。
恐らくその結果なのだろうと思うのですが、3D VISION環境が無いと3D動画を3Dで見られないっぽいですね。
困る。
解決法をご存知の方がいらっしゃいましたら教えてください！(>_<)

youtube 

【追記】
IEなら大丈夫みたいです。
クロームだと、直接でも埋め込みでもダメみたいです。